明嘉靖六年（1527年）十一月二十日，王阳明到达广西梧州开府办公，着手进行实地调查。
梧州在汉代叫苍梧州，属交趾郡。思恩州和田州，即今南宁以北及武鸣县西北和百色市及田阳、田东一带地区，是一片多民族杂居的荒蛮之地，与交趾国接壤。这里深山绝谷中的瑶族人结寨而居，少则几百，多则上千，向来采取民族自治政策，州长官都是当地的土司。他们其实可作为明王朝的西南屏障。如果尽杀其人，改土归流，等于自撤藩篱。所以王阳明更倾向于安抚为主。十二月一日，王阳明向朱厚熜呈上了《谢恩疏》，感谢朝廷委以重任，并表明了自己对于田州叛乱的态度以及处理方法。
王阳明认为，田州在地理位置上十分重要。而当年岑猛造反实是事出有因。根据有关记载，岑猛多次带领他的部队参与政府军的军事行动，事后却没有得到任何奖赏。岑猛本就心怀不平，地方政府官员又向他索贿，这自然激起了他的反意。岑猛为了扩展在桂西的势力，充当起桂西土司盟主，率田州土司兵四处征讨各州府。而广西官军战斗力很差，与岑猛叛军交战，几乎是一触即溃。
前任广西都御史、总督姚谟、总兵朱麒调集三省八万重兵，耗费巨额钱粮，分三路攻入田州。岑猛兵败后逃往归顺州岳父岑璋家。最后岑璋被迫诱杀了岑猛，岑猛之乱就此被平定。但官府在后期治理上陷入泥潭，在桂西强行推行改土归流政策，引起田州土司不满，岑猛余党王受、卢苏再次起兵反叛。而卢苏、王受也并非恶贯满盈之徒，带头闹事实属迫不得已。姚谟大军压境，欲一举将他们置于死地。二人只好负隅顽抗，凭借地利人和之便，让官军进退失据，难竟全功。
对此，王阳明认为派兵镇压终究不是根本上解决问题的办法，应该以招抚为主，而不以征剿为主。其中原因是制度设计：“且思恩自设流官，十八九年之间，反者数起，征剿日无休息。浚良民之膏血，此流官之无益，亦断可识矣。”就是说，造成当今局面的关键原因不在当地老百姓，而是朝廷的问题。
所以他的平乱方针就是“以抚代剿，土流并用”。王阳明在奏疏中说：“感谢皇上能信任我，让我担负如此重任，虽然身体状况不佳，但我会竭尽全力让田州乃至广西恢复秩序，保境安民。”
不过，分管军事的大学士桂萼却节外生枝，好大喜功。他命令王阳明镇压完广西思田之乱后，再去攻打安南。王阳明得知后皱眉摇头不已：广西都乱成这样，还去攻打安南？这位桂大学士是嫌天下安定太久了还是嫌不够乱啊？他在给方献之的信中说：“思、田之事已坏，欲以无事处之，要已不能。只求减省一分，则地方亦可减省一分之劳扰耳。此议深知大拂喜事者之心，然欲杀数千无罪之人，以求成一将之功，仁者之所不忍也。”
在朝廷里，黄绾和方献夫坚决反对这一荒唐的念头，桂萼方才作罢，心中却对王阳明很是不满。
嘉靖七年（1528年）正月，王阳明调集湖广和福建、广东部队抵达梧州。
此时，王阳明胸中酝酿已久，应对之策就是招抚。他深知这次王受和卢苏领头造反完全是官府逼出来的。他们后来攻城略地，也不过是想增加和政府谈判的筹码。过了元宵节，王阳明决定先对造反的土匪们示强：组织数万人进驻南宁，并举行大规模演习。果然，这场军事演习让王受和卢苏受到惊吓，急忙加紧备战。
然后，王阳明和部属们开会商议进剿之策。有人说既然部队已来了，就应该打。王阳明认为攻心为上，攻城为下。王受和卢苏手中实力不弱，田州和思恩的防御已被加固，地理形势对官军不利，短时间内恐怕难以攻下来。只用强攻，徒耗金钱和士兵的生命。更重要的是，哪怕最后强攻下来，如果人心未服，还是会再次反叛。因此，王阳明主张招抚。
这引起了广西地方官们的强烈反对，因为此前姚谟曾招抚过王、卢二人，可是并没有效果。王阳明笑笑：“那是因为招抚的方法不对，火候掌握不当。姚谟和他们谈判时，根本没有动用军队，当然谈不拢。现在不同了，官军从四面云集，那场军事演习就是施加军事压力。我们如今先礼后兵，晓以利害。”
与会众人听了不再反对，但有些将信将疑。特别是一些想借机建功的军官更是不以为然：如果用招抚，那何必辛辛苦苦跑到广西一趟？他们暗中抵制王阳明的招抚计划。在王阳明的使者还未到达匪区时，王、卢二人便收到了消息：王阳明的招抚不可信，他是想借此向你等索贿，而且数额巨大。如果不能满足，后果可想而知。王、卢二人得知，深信不疑，赶走了王阳明的使者。
这让王阳明一下子陷入了被动。他明白问题出在内部。如果现在大力整肃，时间已来不及了。王阳明决心直接给王、卢二人写信，诉诸人性的良知，直攻敌人灵魂深处。
他在信中首先对王、卢当初的遭遇表示深深的同情，并指出政府有错在先；其次，他真诚地保证，只要两人接受招抚，将来绝不会再发生官逼民反的事，保证会给他们生命和自由，把广西建成一个理想的乐土；最后，王阳明严肃地说：“你们投降对大家都有好处，可以免掉兵戎相见的尴尬。你们的决定会让很多人的生命得以保全，活人一命可是胜造七级浮屠。”
这封信并没有取得意想中的效果，因为王受和卢苏有顾虑。他们对官府的话一向持怀疑态度。更何况，当初王阳明在南赣巡抚任上对付池仲容用的不就是这一套吗？池仲容最后不是被杀掉了吗？但是，如果真的和王阳明硬碰硬，还真的很难说是个什么下场。王阳明的用兵之神天下皆知。
在南赣，虽说有池仲容的例子，但也有卢珂、黄金巢招安成功并得到重用的例子。何况王受和卢苏其实也并非真想反叛朝廷。如果不是官逼民反，他们也不想落草为寇。两人决定派人去见见王阳明，探探口风也好。来人转达了王、卢二人的意思：“我们早就想放下武器，可有许多朝廷官员总是欺诈我们，好多人放下武器后遭到了屠杀，或者是提出的很多条件被漠然置之。”
王阳明对来人态度十分热情诚恳，告诉他朝廷招抚的意愿是真诚的，要王、卢二人放心。送走使者后，他就命令湖广部队回老家，只有广西一支没有规模的部队驻扎在南宁。王受得知后，认为王阳明这次招抚是真心实意的。卢苏则谨慎地表示看看再说。
王阳明知道他们在观望犹豫，就派人给他们送去了归顺免死牌，声称只要他们投降，既往不咎，并且在生活上给予优待。于是，他们给王阳明写信提出要求：我们可以去南宁，但我们要接管南宁所有防务，诸如守城门、官衙站岗、城内巡逻，等等。
这个要求确实有些过分，一般官员根本不会答应。当时有人就坚决反对照办，这会让自己陷入危险境地。王阳明心中有数，坦然表示：“人人都有良知，既要招安，当然要拿出诚意。”他让手下官员们完全照办，不要打任何折扣。
明嘉靖七年（1528年）二月中旬，王受和卢苏把南宁城的部队都换成自己人后，慢慢地进了南宁城。城中街道整饬一新，繁华依旧，车水马龙。南宁官衙门口挂着大红灯笼，颇有几分喜庆气氛。他们看到衙门口的卫兵就是自己派来的人，整个南宁城军队中没有见到陌生人。这回，卢苏放下心来，心想即使谈判失败，也能全身而退。
王受则完全放了心，和卢苏按照约定，让随从们把他们反绑，并在两臂之间插上一根荆条，这就是“负荆请罪”之意。王阳明坐在堂上，仪态威严。王受和卢苏跪在地上，请求责罚。王阳明和气地说道：“本来你们主动来降，不应该责罚你们。可是，你们造反是事实，如果不惩罚你们，会让更多的人抱有侥幸之心。所以，我要惩罚你们。”王受和卢苏闻听吃了一惊。
王阳明接着说道：“你们可穿上盔甲，揍你们二百军棍。”说完他就让人手持军棍开打。二人就穿上盔甲接受处罚。二百军棍执行完毕，王阳明走下来，命人把他们的盔甲脱掉，拉着二人的手说：“两位深明大义，对我深信不疑，我真的很感动。既然二位对我如此真心，我也就不客气了，有件事需要你们二人帮忙。”
王受十分感动：“王大人但说无妨，我哥儿俩万死不辞。”卢苏也表示一定尽心竭力。王阳明点了点头说：“很好，我希望二位能帮我稳定广西。”
王受拍着胸脯说：“这事包在我哥儿俩身上。我二人能助王大人扫平叛乱。”
就这样，王阳明一下就把广西最大的叛乱武装拿下了。一位王门弟子认为这比多年前大禹治水有过之而无不及。思恩、田州之乱，不伤一兵一卒迅速平定，充分显示了王阳明良知心学的巨大同化力，彰显了其超凡的政治与军事才能，在其一生功业中，堪称完美的收官之作。
在南宁操劳数月后，嘉靖七年（1528年）四月，王阳明一病不起。他向朝廷提出致仕退休的请求。
这个时候，那位大学士桂萼却执意要王阳明必须解决安南问题。很多人不解：这位桂大学士为何如此执着于安南呢？据说这桂萼年轻时就有一个梦想，就是将安南重新纳入大明版图，以建立开疆拓土的不世之功。哪知这王阳明的态度却一再让他这个梦想落空。
王阳明得知后，对弟子们叹息：“看来广西要成我葬身之地了啊。桂萼让我进攻安南，这是异想天开。安南的确在内乱，可广西全境有几处是安宁的？如果我不照做，这次广西平灭之功可能又是一场空。如果我去打安南，可能会兵连祸结，无法收拾。”
这时弟子建议：“既如此，不如早些回家乡余姚去。”王阳明闻听，沉吟良久，颇为心动。
不过，广西平乱还没有真正结束，断藤峡和八寨还有悍匪盘踞，长期祸乱一方。只是朝廷还根本不知道，也不在此次平乱规划之中。王阳明是在同当地父老闲聊中才偶然得知。他原本可以班师回朝，却临时决定彻底为民除害。
这时，一些部属，包括门生弟子都来劝王阳明见好就收。“先生来此主要是平田州、思恩之乱的，没有旨意让您去平定断藤峡和八寨。现在卢苏、王受已经平定，先生病得这么严重，何不收兵班师？”
王阳明摇摇头，说道：“我来广西，一者为圣上所命，二者为我内心的良知所命。匪乱不除，天下不安。”